如何解决如何修复热图图例超出边距?
我想增加热图的字体大小,但我发现当图例名称长而图例组名称短时,图例很容易超出边距。例子如下:
test = matrix(rnorm(200),20,10)
test[1:10,seq(1,10,2)] = test[1:10,2)] + 3
test[11:20,seq(2,2)] = test[11:20,2)] + 2
test[15:20,2)] = test[15:20,2)] + 4
colnames(test) = paste("Test",1:10,sep = "")
rownames(test) = paste("Gene",1:20,sep = "")
annotation_col = data.frame(
C = factor(rep(c("longCT1","longCT2"),5))
)
rownames(annotation_col) = paste("Test",sep = "")
pheatmap::pheatmap(test,annotation_col = annotation_col,cluster_cols = F,scale = "row",fontsize = 20)
可以看到图例名称C
较短,而lenengned组名称longCTx
较长,设置大字体时,会超出边距:
那么在这种情况下,当我想增加热图的字体大小时如何解决?
解决方法
一个简单的解决方案是在组名的末尾添加一些空格。见下文:
# Add blanks to groups names
annotation_col = data.frame(
C = factor(rep(c("longCT1 ","longCT2 "),5))
)
rownames(annotation_col) = paste("Test",1:10,sep = "")
pheatmap::pheatmap(test,annotation_col = annotation_col,cluster_cols = F,scale = "row",fontsize = 20)
版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。