运行docker镜像时如何从其他目录引用文件？

如何解决运行docker镜像时如何从其他目录引用文件？

我尝试使用 docker 镜像运行程序 SAIGE-GENE。在将 docker pull 与 docker pull wzhou88/saige:0.43.2 一起使用后，我能够让它运行。

但是，我无法使用 docker exec 定位输入文件。我的文件在桌面上，我已经 cd 到这个目录了。我使用的命令如下：

docker exec -w /Users/garyzhubc/Desktop d7501bd45226 /usr/local/bin/step2_SPAtests.R \
  --bgenFile=ukb_imp_chr1_v3_pruned_reduced.bgen \
  --bgenFileIndex=ukb_imp_chr1_v3_pruned_reduced.bgen.bgi \
  --sampleFile=ukb_imp_chr1_v3_pruned_reduced.sample \
  --chrom=1 \
  --minMAF=0 \
  --minMAC=0.5 \
  --maxMAFforGroupTest=0.01 \
  --GMMATmodelFile=./output/example_quantitative.rda \
  --varianceRatioFile=./output/example_quantitative_cate.varianceRatio.txt \
  --SAIGEOutputFile=./output/example_quantitative.SAIGE.gene.txt \
  --numLinesOutput=1 \
  --groupFile=group_file.tsv \
  --sparseSigmaFile=./output/example_quantitative_cate.varianceRatio.txt_relatednessCutoff_0.125_2000_randomMarkersUsed.sparseSigma.mtx \
  --IsSingleVarinGroupTest=TRUE \
  --LOCO=FALSE

因为它仍然无法找到文件，所以这不起作用

OCI runtime exec failed: exec failed: container_linux.go:370: starting container process caused: chdir to cwd ("/Users/garyzhubc/Desktop") set in config.json failed: no such file or directory: unknown