为什么在Pyspark Dataframe上切片,拆分和存储数据会很费时?

如何解决为什么在Pyspark Dataframe上切片,拆分和存储数据会很费时?

我对Pyspark还是陌生的,我正在处理大量文件。我大约有2.5 TB的数据,并且正在从每个文件中提取一些元数据并将其存储在Dataframe中。下表中给出了这种元数据的示例

|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   ID  | FileType | Metadata | AssociatedID |    Group ID  |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   1   |  Type 1  |   xyz    |       3      |       A      |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   2   |  Type 1  |   fgh    |       4      |       A      |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   3   |  Type 2  |          |              |       A      |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   4   |  Type 2  |          |              |       A      |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   5   |  Type 4  |          |              |       A      |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|

一旦我提取了此元数据,便要将其存储在CSV文件中。我要存储它的方式基于以下逻辑。

  1. 获取FileType为1的唯一元数据-> ['xyz','fgh']
  2. 浏览每个唯一的元数据,并获取属于同一组且具有FileType Type 2的关联FileType-> 如果元数据值为xyz,则我的子集数据帧现在将包含第1行和第3行
  3. 获取属于同一组但不是类型1 /类型2的其余文件类型

因此,元数据xyz的最终子集数据帧将包含:

|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   ID  | FileType | Metadata | AssociatedID |    Group ID  |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   1   |  Type 1  |   xyz    |       3      |       A      |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   3   |  Type 2  |          |              |       A      |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|
|   5   |  Type 4  |          |              |       A      |
|-------|----------|----------|--------------|--------------|

执行此操作的代码如下:


    uniqueMetadata= sdf_.select("Metadata").distinct().collect()
    for meta in uniqueMetadata:
          # Get the rows that have metadata 'xyz'
          metadata_df = sdf_.filter(col("Metadata") == meta) 

          #Get All Group ID's of those groups that have a metadata xyz
          groupIDs= metadata_df .select("GroupID").distinct().collect() 
          groupIDs= [v["GroupID"] for v in groupIDs] #Convert to List

          for groupID in groupIDs: #Iterate Group IDS

            #Get all records for particular Group ID
            groupID_df = sdf_.filter(col("GroupID") == groupID) 

            #Get all Associated ID's of metadata xyz in that group
            uniqueAssociatedIDs= groupID_df .select("AssociatedID").distinct().collect() 
            uniqueAssociatedIDs= [v["AssociatedID"] for v in uniqueAssociatedIDs] #Convert to List

            #Get All Rows with matching Associated IDs
            matchingAssociatedDF = groupID_df .filter(col("ID").isin(uniqueAssociatedIDs)) 
            metadata_df = metadata_df .union(matchingAssociatedDF ) 

            #Get All Other Rows in the same group that are not FileType1/Type2
            other_df = groupID_df .filter((~col("ID").isin(uniqueAssociatedIDs)) & (~col("FileType").isin(["Type 1","Type 2"])))
            metadata_df = metadata_df .union(other_df) 
            df_path = output_path + "/" + "/ByMetadata/" + metadata + "/" + shortuuid.uuid() + "/" 
  
            #Save in Location
            metadata_df .coalesce(8).write.format("com.databricks.spark.csv").option("header","true").save(df_path)

此代码的问题是计算和存储需要太多时间。对于200个组和大约200个唯一的元数据,要花费48个小时以上,这不好,因为我必须分批处理大约100000个组。

在pyspark中是否有更好的解决方案可以对此进行优化?我可以尝试哪种优化? Pyspark是否不用于这种类型的查询和切片?

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