奇点3.6.2安装

如何解决奇点3.6.2安装

我在linux mint中安装奇点3.6.2时遇到问题，我遵循https://sylabs.io/guides/3.0/user-guide/installation.html的说明。 我安装了依赖关系和Go。

然后我运行命令以安装最新版本：

export VERSION=3.6.2 && # adjust this as necessary \
mkdir -p $GOPATH/src/github.com/sylabs && \
cd $GOPATH/src/github.com/sylabs && \
wget https://github.com/sylabs/singularity/releases/download/v${VERSION}/singularity-${VERSION}.tar.gz && \
tar -xzf singularity-${VERSION}.tar.gz && \
cd ./singularity && \
./mconfig

错误是：

    Configuring for project `singularity' with languages: C,Golang
=> running pre-basechecks project specific checks ...
=> running base system checks ...
 checking: host C compiler... cc
 checking: host C++ compiler... c++
 checking: host Go compiler (at least version 1.13)... not found!
mconfig: could not complete configuration

我要去了（去版本）

go version go1.15.2 linux/amd64

我不知道发生了什么！ 非常感谢！

解决方法

该问题已在5099中报告。

# 5320还提到：

我删除了PPO python 3.6，它工作正常！

确保没有任何用户以root身份执行，其$ PATH与当前用户不同。

,

我一直在遇到同样的错误。所有建议都表明您可能拥有旧版本的Go，这就是原因。但是事实证明，将Go和Singularity放置在正确的位置更为重要。

我发现这些文档https://github.com/hpcng/singularity/blob/release-3.5/INSTALL.md对于将目录放置在何处最有用和正确。

关键是要在GOPATH目录中克隆奇点：

默认情况下您将没有此目录，因此请先创建它

$ mkdir -p ${GOPATH}/src/github.com/sylabs && \
  cd ${GOPATH}/src/github.com/sylabs && \
  git clone https://github.com/sylabs/singularity.git && \
  cd singularity

确保您的奇点在这里： {GOPATH} /src/github.com/sylabs/singularity

总结：

Go本身位于/usr/local/go

GOPATH类似于home/your_username/go，而奇点将位于例如home/your_username/go/src/github.com/sylabs/singularity

,

如果有人遇到此问题，请按照此安装 guide。

sudo apt-get update && \
sudo apt-get install -y build-essential \
libseccomp-dev pkg-config squashfs-tools cryptsetup

sudo rm -r /usr/local/go

export VERSION=1.13.15 OS=linux ARCH=amd64  # change this as you need

wget -O /tmp/go${VERSION}.${OS}-${ARCH}.tar.gz https://dl.google.com/go/go${VERSION}.${OS}-${ARCH}.tar.gz && \
sudo tar -C /usr/local -xzf /tmp/go${VERSION}.${OS}-${ARCH}.tar.gz

echo 'export GOPATH=${HOME}/go' >> ~/.bashrc && \
echo 'export PATH=/usr/local/go/bin:${PATH}:${GOPATH}/bin' >> ~/.bashrc && \
source ~/.bashrc

curl -sfL https://install.goreleaser.com/github.com/golangci/golangci-lint.sh |
sh -s -- -b $(go env GOPATH)/bin v1.21.0

mkdir -p ${GOPATH}/src/github.com/sylabs && \
cd ${GOPATH}/src/github.com/sylabs && \
git clone https://github.com/sylabs/singularity.git && \
cd singularity

git checkout v3.6.3

cd ${GOPATH}/src/github.com/sylabs/singularity && \
./mconfig && \
cd ./builddir && \
make && \
sudo make install

singularity version