如何解决奇异配方:如何在容器内访问可执行文件?
我是具有奇点的初学者。
从长远来看,我要实现的目标是:我有一个编程项目,其中包含大量依赖项,并且希望能够将该程序提供给公司中的其他人,而不会因缺少依赖项而导致错误,或错误版本的依赖项。
现在的想法是使用奇点,以便轻松提供工作环境。
为了对此进行测试,我编写了一个Hello World应用程序,该应用程序现在要在容器中运行。我有一个文件夹HelloWorld/
,其中包含C ++ Qt项目的源代码。然后,我编写了以下配方文件:
project.recipe
Bootstrap: docker
From: ubuntu:18.04
%setup
cp -R <some_folder>/HelloWorld ${SINGULARITY_ROOTFS}/HelloWorld
%post
apt update
apt-get install -y qt5-default
apt install -y g++
apt-get install -y build-essential
cd HelloWorld
qmake
make
echo "after build:"
ls
%runscript
echo "before execution:"
ls HelloWorld/
./HelloWorld/HelloWorld
回显和目录列表用于我当前的调试过程。
我可以使用sudo singularity build --writable project.img project.recipe
成功地构建图像文件。 (我的调试输出显示可执行文件已成功构建。)
现在的问题是,如果尝试使用./project.img
或singularity run project.img
运行它,它将找不到可执行文件。
使用调试输出,我发现%runscript
中的行使用了容器外部的文件夹。
像https://sylabs.io/guides/3.1/user-guide/build_a_container.html这样的教程使我觉得我的食谱似乎是必经之路,但显然不是吗?
我的问题:
- 我可以通过某种方式访问可执行文件吗?我说错了吗?
- 我是按照应该做的方式来做的吗?还是通常会做一些事情,例如将可执行文件移出容器,然后使用容器来调用该外部文件?还是有不同的最佳做法?
- 如果在编译后将可执行文件复制到容器外部,该怎么办?我在
%post
内时如何访问外部文件夹? - 这是我想要实现的最佳工作流程吗?后来,我的想法是将大项目同样复制到容器中,安装或复制依赖项,然后编译项目,最后删除其源代码。我还考虑过使用存储库,但是我不能将项目放在开放的存储库中,而且我也不想存储任何密码。
解决方法
- 首先,使用
%files
,不要使用%setup
。%setup
以root身份运行,可以直接修改主机服务器。您可能很容易意外地破坏事物而没有意识到。您可以通过这种方式获得相同的效果:
%files
some_folder/HelloWorld /HelloWorld
-
您在说错了。在您的
%setup
步骤中(希望现在在%files
中),您正在将数据复制到/HelloWorld
。在您的%runscript
中,您正在呼叫./HelloWorld/HelloWorld
,相当于$PWD/HelloWorld/HelloWorld
。由于奇点会自动挂载在$PWD
(以及$HOME
和其他目录)中,因此您不会调用要调用的内容。 -
您无需将可执行文件复制到容器外部,只需确保执行的内容在您认为的位置即可。
-
%post
中无法访问主机文件系统,您应该首先通过%files
复制所需的所有内容。 -
那是一个合理的工作流程。拥有一个本地私有代码仓库可能是跟踪您的更改的一个好主意,但这就是您的要求。
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