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linux系统中awk命令提取特定列、添加列
1、创建测试数据 [root@linuxprobe test]# seq -w 24 | xargs -n 4 | awk '{print "<"NR,$0}&#39
linux 系统 安装 gfortran
1、使用yum 直接安装gfortran yum install -y gfortran 报错如下： 2、百度查找，主要参考 https://blog.csdn.net/HOMEGREAT/
linux 系统如何删除特定的行
1、vi编辑 首先利用 vi filenae 查看文件， 在命令行模式下 使用 :g/string/d 执行命令即可删除含有 string字符串的行 ，其中string为字符串 2、sed [root
yum install epel-release 报错 解决 记录
1、目的 linux 系统中 安装 R ，参考如下链接： https://blog.csdn.net/haijiege/article/details/83828173 a.安装并启动EPEL（如果已
linux系统vim编辑器的使用 页面跳转
1、 跳转至最后一行：G (命令模式下G、或者shift+g、 末行模式下输入 “:$”) 跳转至第一行：gg (命令模式下gg ，或者在末行模式下输入 “:0”) 跳转至指定行：10+G (命令模式
httpd-2.4.6-17.el7.x86_64: [Errno 256] No more mirrors to try 的解决方法
1、yum 安装httpd过程中出现问题： yum install httpd -y 2、百度了一下，好像是什么没有挂载，查看当前的挂载信息： df -h 3、重新挂载光盘 mkdir -p /med
linux cut 命令的用法
1、创建了一个示例数据a.txt seq 11 30|xargs -n 5|sed 's/ /\t/g' > a.txt 提取第一列 ： cut -f 1 a.txt 提取第2列
《Linux就该这么学》学习笔记 03
一、工作目录切换命令 1、pwd ：用于显示当前的工作路径 2、cd ：cd 路径：进入指定路径； cd .. :进入上一级目录； cd - : 进入上次所处的路径； cd ~ :
linux系统删除行首空格命令的比较
1、首先使用vim 创建测试数据a.txt, 如下： 测试数据a.txt的行首是空格还是tab（\t）健呢？可以使用如下命令检测： sed -n l a.txt 发现有的是空格，有的是tab，有的是两
linux 系统 如何删除各种形式的空行
1、首先创建测试文件 a.txt、b.txt、c.txt 2、 查看空格类型，使用如下命令： cat -A file a.txt 第二行什么都没有 b.txt 的第二行为空格 c.txt文件第二行为t
linux 系统 PCRE(Perl Compatible Regular Expressions) 相关
1、pcre 编译 ./configure --enable-utf8 --enable-unicode-properties make make install 2、查看pcre 版本 pcre默认
linux系统如何提取奇数列
1、遇到一个数据需要提取奇数列 创建测试数据 [root@linuxprobe test]# seq -f %03g 60 | xargs -n 30 > test.txt[root@linux
Can't exec "epstopdf": No such file or directory 报错解决
1、运行perl程序遇到如下报错，Can't exec "epstopdf": No such file or directory 2、 安装 epstopdf
linux系统下安装R-3.5.3
背景：前面装的R最新版R-4.0.2，编译一直报错，尝试了多种方法，没解决，考虑换低版本R试一下。 R-4.0.2编译报错如下： 1、R-3.5.3软件的下载、编译 wget https://mirr
linux 系统如何给软件设置环境变量
安装软件后，如果不针对软件的可执行程序设置环境变量，则在每次使用软件时，均需要调用软件可执行程序的绝对路径，相对繁琐。 以下以plink软件为例，将plink的可执行程序加入环境变量。 1、首先下载p
《Linux就该这么学》学习笔记 04
管道符、重定向和环境变量 一、输入输出重定向 1>: 表示标准输出，1可以省略； 2> ：表示标准错误输出，2 一定不能省略。 > : 输出重定向，将清空原有的内
samtools软件安装中 configure: error: liblzma development files not found 报错的解决方法
1、安装samtools 软件中 遇到如下错误： ./configure 2、解决办法： yum -y install xz-devel 参考：https://support.huaweicloud.
samtools软件安装中 configure: WARNING: S3 support not enabled: requires SSL development files 的解决方法
1、samtools软件安装中遇到如下问题： ./configure 2、解决方法 yum install gcc gcc-c++ zlib zlib-devel openssl openssl-de
linux redhat8 /usr/bin/env: ‘python’: No such file or directory gatk安装报错解决方法
1、安装gatk-4.1.8.1遇到如下报错： 2、检测python 发现只有python3 3、为Python3建立软连接： 4、测试python 和 gatk 已经可以使用。
linux系统 如何提取奇数列
1、遇到一个数据需要提取奇数列 [root@linuxprobe test]# cat test.txtc1 c2 c3 c4 c5 c6 c7 c8 c9 c10 c11 c12 c13 c14 c
samtools软件安装中 configure: WARNING: libcurl not enabled: library not found 的解决方法
1、samtools安装过程中遇到： ./configure 2、解决方法： yum -y install libcurl-devel 参考：https://www.cnblogs.com/vania
linux hedhat8 安装 java环境
1、在使用gatk 构建 索引文件过程中报错如下： 2、查看java java java --version echo $JAVA_HOMErpm -qa|grep jdk 发现没有安装java。 3
samtools软件安装中 configure: error: curses development files not found 报错的解决方法
1、安装samtoos软件过程中遇到如下报错： ./configure 2、解决方法，参考：http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=3
samtools软件安装中 configure: error: libbzip2 development files not found 报错的解决方法
1、安装samtools软件过程中遇到如下错误： ./configure 2、解决办法： yum -y install bzip2-devel 参考：https://github.com/samtoo
linux 系统sed命令如何提取奇数行、偶数行及整倍数行
1、创建测试数据 [root@linuxprobe test]# seq 30 > a.txt [root@linuxprobe test]# ls a.txt [root@linuxprobe
java.io.FileNotFoundException: (Too many open files) gatk MarkDuplicates标记重复报错解决
1、使用gatk 对 排序后bam文件进行标记重复出现如下报错： 经过查询，是由于服务器对一次进程可以同时打开的文件数目有限制导致报错。 可以通过Linux系统打开文件最大数量限制设置解决。 2、查看
redhat8 红帽8 bash: make: command not found...报错的解决方法
1、redhat8安装zlib库的时候遇到使用make命令报错： 发现没有make命令： 2、通过查找 参考 https://blog.csdn.net/m0_46622166/article/det
linux 系统 awk命令提取奇数行、偶数行及整数倍行
1、创建测试数据 [root@linuxprobe test]# seq 20 > a.txt [root@linuxprobe test]# ls a.txt [root@linuxprobe
sh: gnuplot: command not found 报错记录
1、sh: gnuplot: command not found 2、 安装 yum install gnuplot
linux系统 comm命令
1、comm 用于对两个文件取交集或者并集， 用法 comm file1 file2，生成三列数据，第一列file1唯一的行，第二列file2唯一的行，第三列file1和file2共有的行 创建测试数
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